Explorar los genomas para mejorar la sanidad animal

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La FAO y el Instituto Suizo de Bioinformática (SIB) se asocian para desarrollar herramientas de tecnología punta para luchar contra la gripe aviar y otras enfermedades infecciosas

10 de febrero de 2015, Roma – La FAO ha elegido al Instituto Suizo de Bioinformática (SIB) como centro de referencia para ampliar su acceso a tecnologías más avanzadas en la lucha contra las infecciones virales peligrosas en animales de granja y silvestres, incluyendo la gripe aviar y la fiebre aftosa.

El SIB está equipado con ordenadores de alto rendimiento, programas informáticos, bases de datos y de conocimiento usados para la detección y seguimiento de enfermedades zoonóticas. Estas, como la gripe aviar, afectan a los animales, pero también pueden transmitirse a las personas.

Trabajando en estrecha colaboración con la FAO, los expertos del SIB han desarrollado herramientas para mejorar la detección precoz y los sistemas de alerta rápida para prevenir y responder a las emergencias de enfermedades transfronterizas en las aves de corral o el ganado.

“La nueva tecnología nos ayuda a entender las amenazas biológicas con el fin de ayudar a los países a prevenir y responder mejor, y en última instancia, proteger la salud de los seres humanos, los animales y el medio ambiente”, aseguró el Jefe del Servicio Veterinario de la FAO, Juan Lubroth.

Bioinformática

El SIB está especializado en bioinformática, una ciencia relativamente nueva que emplea ordenadores para estudiar datos biológicos. Los científicos usan la bioinformática para reunir, procesar y analizar información sobre los genomas de patógenos: el material genético propio de microorganismos específicos, como virus, bacterias y hongos que causan enfermedades en sus portadores.

Esto les permite comparar los genomas, entender las estructuras de las proteínas, e identificar cómo funcionan las enfermedades a nivel molecular. Esta información hace que los científicos puedan desarrollar nuevos medicamentos y tratamientos específicos, así como mejorar la eficacia de los medicamentos existentes.

Las nuevas tecnologías juegan un papel importante en la comprensión de la naturaleza y la dinámica de las amenazas biológicas, y la FAO, en colaboración con la SIB, ha desarrollado cursos de aprendizaje en línea sobre bioinformática en patógenos virales que pueden ayudar a técnicos de laboratorio, médicos, veterinarios e investigadores de todo el mundo a mejorar su trabajo y aumentar el acceso a este campo emergente.

Compartir conocimientos

La base de datos del SIB ofrece información al Sistema mundial de información de la FAO sobre enfermedades animales (EMPRES-i), aplicación en la web que da acceso a los servicios veterinarios a información sobre enfermedades animales a nivel regional y mundial.

En particular, las bases de datos del SIB disponibles en OpenFlu -ya vinculadas a EMPRES-i y que combinan información virológica y epidemiológica- y en OpenFMD, proporcionan recursos sobre el virus de la gripe y la fiebre aftosa, respectivamente. Esto ayudará a los científicos de países en desarrollo a contribuir directamente a la base mundial de conocimientos sobre estas enfermedades y evaluar adecuadamente el riesgo que representan para sus países.

Las iniciativas conjuntas futuras incluyen un módulo genético para la fiebre del Valle del Rift – enfermedad viral potencialmente devastadora para el ganado y que también puede transmitirse a los seres humanos- la peste de los pequeños rumiantes y la peste porcina africana.

Centros de referencia

Los Centros de referencia de la FAO son considerados centros de excelencia en la prestación de asesoramiento científico y técnico en temas relacionados con el mandato de la Organización. La FAO ha identificado 18 áreas técnicas para las requiere actualmente la colaboración de los Centros de referencia.

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Crunching genomes to boost animal health

FAO and SIB Swiss Institute of Bioinformatics team up to develop high tech tools to fight bird flu and other infectious diseases

10 February 2015, Rome – FAO has chosen the SIB Swiss Institute of Bioinformatics as a designated reference centre to expand its access to state-of the-art technology in combating dangerous viral infections, including avian influenza and foot-and-mouth disease, in farm animals and wildlife.

The SIB is equipped with high performance computers, software, databases and a knowledgebase used for screening and monitoring zoonotic diseases. These, like avian influenza, also known as bird flu, strike animals but can also be transmitted to humans.

Working closely with FAO, SIB experts have developed tools to improve early detection and fast alert systems to prevent and respond to transboundary disease emergencies in poultry or livestock.

«The new technology helps us understand biological threats in order to help countries better prevent, respond and ultimately protect the health of humans, animals and the environment,» said FAO’s Chief Veterinary Officer, Juan Lubroth.

Bioinformatics

SIB specializes in bioinformatics, a relatively new science which employs computer technology to study biological data. Scientists use bioinformatics to gather, process and analyse information on the genomes of pathogens – the genetic material peculiar to specific micro-organisms, such as viruses, bacteria and fungi that cause diseases in their hosts.

This lets them  compare genomes, understand protein structures, and identify how diseases work at the molecular level. Such information enables scientists to develop new drugs and targeted treatments as well as improve the effectiveness of existing medicines.

The new technologies play an important role in understanding the nature and dynamics of biological threats, and FAO, in collaboration with SIB, has developed online e-learning courses on bioinformatics in viral pathogens that can help laboratory technicians, physicians, veterinarians and researchers around the world improve their work while increasing access to this emerging field of competence.

Sharing vital knowledge

SIB’s database feeds information into FAO’s Global Animal Disease Information System (EMPRES-i), the web-based application that supports veterinary services access regional and global disease information.

In particular SIB’s databases on OpenFlu – already linked to EMPRES-i and combining virological and epidemiological information – and OpenFMD, provide resources on influenza and foot-and-mouth viruses respectively. This will help scientists in developing countries contribute directly to the global knowledge base on these diseases and properly assess the risk posed to their countries.

Future joint initiatives include a genetic module for Rift Valley fever – a viral disease that is potentially devastating to livestock and can also be transmitted to humans – peste des petits ruminants, and African swine fever.

Reference Centres

FAO Reference Centres are regarded as centres of excellence in providing scientific and technical expertise on issues related to the agency’s mandate. FAO has identified 18 technical areas for which collaboration with Reference Centres is currently required.